1989年 金陵男科医院的奠基人徐元诚牵头组织成立了全国第一个男科学术团体—— 南京医学会男科分会。
1990年 南京医学会男科分会和《男性学杂志》（《中国男科学杂志》前身）编辑部共同举办了全国男科学大会，这次会议被王一飞教授誉为中国男科学发展的里程碑。
1991年 南京卫生局（1992年1号文）正式批准 “南京金陵男科医院”。突破了《国家医疗管理条例》中没有“男科”设置的瓶颈，开创了中国“男科医院”的先河。
1992年 新成立的金陵男科医院在江苏省科协的支持下、在著名男科专家钱绍祯教授的指导下，成功地举办了亚洲太平洋首届男科学大会。
1993年 在江苏省人民医院冯善章教授指导下开展人工授精技术研究，治疗不孕不育。
1994年 创办《男科通讯》并免费邮寄给全国男科学界的同道，为以后更名为《男科学报》、《中华男科学杂志》并成为国内外有影响力的专业性期刊打下了基础。
1994年 在全国率先开展可弯曲棒状假体植入术
1995年 与南京军区总院合作研发的MACRO精子计数板获国家专利，目前已被国内男科实验室广泛使用。
1996年 再次在国内率先开展国际男科前沿技术---可膨胀性阴茎假体植入手术。
1997年 举办全国男科学术大会暨全国新技术进展学习班。
1998年 被亚洲男科学会确定为临床科研协作中心。
2000年 成为南京市卫生系统首家国有试点改制股份制医院。 2000年 在益来基因公司支持下开展试管婴儿技术（AIF）治疗不孕不育，并开展了人类精子库的申报探索工作。
2001年 成为江苏卫生厅首批获准开展夫精人工受精（AIH）技术准入单位
2002年 在全国率先开展阴茎勃起功能医学鉴定，受公、司、法等部门委托，先后为苏、浙、 皖、鲁等省市ED患者做出医学鉴定。
2002年 组织成立江苏省中西医结合学会生殖医学分会，担任主任委员单位。
2002年 组织召开全国中西医结合、生殖医学学术交流会及生殖医学技术新进展学习班。
2002年 将腔镜技术（宫腔镜，腹腔镜，膀胱镜）等应用于临床男科，妇科工作中。
2002年 成为江苏职工医科大学教学医院。
2003年 组织召开第二届全国中西医结合生殖医学学术大会及生殖医学新技术学习班。
2003年 成立了安徽领先的男科医院——芜湖金陵男科医院。
2003年 与东南大学合作参与AZF基因、男科疾病基因实验室研究。2004年 在全国率先开出同性恋、夫妻性和谐特色门诊。
2004年 在司法部司法鉴定中心朱广友教授指导下在全国率先开展男性阴部神经电生理及诱发电位检查，为阴茎勃起功能障碍及射精障碍患者提供科学诊断依据。
2006年 收购了中外合资南京益来医院。
2006年 与现代家庭报社合作创办《生殖健康》报。
2006年 全国独立，专业性功能司法鉴定机构---南京金陵男科医院司法鉴定所经江苏司法厅批准成立。
2007年 受世界中医药学会联合会、中华中医药学会和国际中医男 科学会的委托，在南京承办了世界中医男科学术大会。
2008年 南京金陵男科医院司法鉴定所荣获司法部“鼎永杯”全国司法鉴定优秀文书一等奖
2010年 受江苏省中医药学会的委托，与江苏省中医院，江苏建康学院一起协办了华东六省一市中医男科大会暨男科新技术学习班。
2010年 金陵男科医院升格为金陵中西医结合医院 .
2010年 创始人徐元诚院长在中华医学会男科学分会成立15周年庆典上获得中国男科事业15年发展开拓贡献奖.
2011年 国内率先推广实施世界卫生组织WHO第五版人类精液检查标准，徐元诚院长发明的新一代全自动精液分析仪获得发明专利。进一步推动了不孕不育诊疗规范和技术的提升。
2011年 投资控股苏州昆山金陵医院。
2011年 南京金陵男科司法鉴定所再次荣获司法部“鼎永杯”全国司法鉴定优秀文书奖。
2012年 金陵男科司法鉴定所成为司法部《中国司法鉴定》杂志副理事长单位，业务覆盖全国22个省市和地区。
2012年 投资控股南京凤凰岛整形美容医院。
2012年 受江苏省中医药学会的委托，与江苏省中医院，江苏建康 学院协办江苏第11次中医男科大会暨男科新技术学习班。
2012年 南京市计划生育委员会授予南京流动人口生殖健康服务站。
2012年 江苏省第七次男科学学术会议暨江苏省医师协会男科学分会扬州会议上，黄宇烽教授、吴宏飞教授和徐元诚教授获得“江苏省医学会男科学分会杰出成就奖”。表彰他们为江苏省医学会男科学分会所做的卓越贡献
2013--2016年 徐元诚院长领导的杰奥福瑞精子研究室与南京医科大学国家生殖重点实验室, 江苏医学会男科分会合作举办五期世界卫生组织第五版精液分析全国培训班，全国20来家精子库和上百名生殖中心人员参与学习。
2017年 金陵男科司法鉴定所成为司法部《中国司法鉴定》杂志副理事长单位，业务覆盖全国28个省市和地区
2018年 按国家《医疗纠纷预防和处理条例》规定开展性功能医疗损害司法鉴定。
2021年 实施落实司法部《司法鉴定标准化工作指南》SF/T 0097-2021。
2023年 金陵男科司法鉴定所业务范围由性功能鉴定更为性功能及生育功能法医临床鉴定。